Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa9P09631 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms