Protein–RNA interactions for Protein: P08228

Sod1, Superoxide dismutase [Cu-Zn], mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sod1P08228 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sod1P08228 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sod1P08228 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sod1P08228 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sod1P08228 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sod1P08228 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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