Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TnfP06804 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TnfP06804 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TnfP06804 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TnfP06804 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TnfP06804 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TnfP06804 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnfP06804 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnfP06804 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnfP06804 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnfP06804 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnfP06804 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TnfP06804 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms