Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms