Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
P06320 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
P06320 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
P06320 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms