Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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PdgfrbP05622 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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PdgfrbP05622 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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PdgfrbP05622 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PdgfrbP05622 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PdgfrbP05622 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PdgfrbP05622 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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PdgfrbP05622 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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PdgfrbP05622 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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PdgfrbP05622 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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PdgfrbP05622 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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