Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HbaP01942 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HbaP01942 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HbaP01942 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HbaP01942 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HbaP01942 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HbaP01942 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HbaP01942 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HbaP01942 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HbaP01942 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HbaP01942 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HbaP01942 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HbaP01942 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HbaP01942 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HbaP01942 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HbaP01942 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HbaP01942 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HbaP01942 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HbaP01942 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HbaP01942 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HbaP01942 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HbaP01942 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HbaP01942 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HbaP01942 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HbaP01942 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HbaP01942 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HbaP01942 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HbaP01942 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HbaP01942 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HbaP01942 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HbaP01942 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HbaP01942 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HbaP01942 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HbaP01942 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HbaP01942 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HbaP01942 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HbaP01942 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HbaP01942 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HbaP01942 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HbaP01942 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HbaP01942 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HbaP01942 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HbaP01942 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HbaP01942 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HbaP01942 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HbaP01942 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HbaP01942 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HbaP01942 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HbaP01942 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HbaP01942 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HbaP01942 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HbaP01942 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HbaP01942 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HbaP01942 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HbaP01942 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
HbaP01942 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HbaP01942 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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