Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01740 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01740 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01740 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01740 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01740 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01740 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01740 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01740 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01740 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01740 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01740 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01740 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01740 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01740 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01740 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01740 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01740 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01740 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01740 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01740 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01740 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01740 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01740 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01740 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01740 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01740 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01740 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01740 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01740 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01740 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01740 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01740 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01740 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01740 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01740 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01740 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01740 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01740 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01740 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01740 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01740 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01740 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01740 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01740 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01740 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01740 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01740 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01740 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01740 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01740 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01740 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01740 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01740 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01740 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01740 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01740 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01740 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01740 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01740 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01740 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01740 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01740 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms