Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01679 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01679 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01679 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01679 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01679 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01679 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01679 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01679 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01679 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01679 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01679 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01679 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01679 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01679 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01679 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01679 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01679 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01679 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01679 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01679 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01679 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01679 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01679 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01679 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01679 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01679 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01679 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01679 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01679 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01679 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01679 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01679 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01679 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01679 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01679 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01679 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01679 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01679 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01679 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01679 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01679 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01679 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01679 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01679 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01679 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01679 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01679 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01679 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms