Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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