Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc1O88447 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Klc1O88447 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms