Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lnx1O70263 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lnx1O70263 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms