Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgceO70258 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgceO70258 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgceO70258 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgceO70258 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgceO70258 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgceO70258 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgceO70258 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgceO70258 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgceO70258 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgceO70258 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgceO70258 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgceO70258 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgceO70258 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SgceO70258 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgceO70258 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgceO70258 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgceO70258 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgceO70258 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgceO70258 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgceO70258 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgceO70258 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgceO70258 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SgceO70258 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgceO70258 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgceO70258 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SgceO70258 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SgceO70258 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SgceO70258 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgceO70258 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgceO70258 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgceO70258 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgceO70258 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgceO70258 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgceO70258 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgceO70258 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgceO70258 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgceO70258 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgceO70258 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgceO70258 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgceO70258 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgceO70258 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgceO70258 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgceO70258 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgceO70258 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgceO70258 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgceO70258 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgceO70258 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgceO70258 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgceO70258 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgceO70258 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgceO70258 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SgceO70258 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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