Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif6O55135 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif6O55135 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif6O55135 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif6O55135 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif6O55135 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Eif6O55135 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms