Protein–RNA interactions for Protein: O55112

Aff2, AF4/FMR2 family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff2O55112 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aff2O55112 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Aff2O55112 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Aff2O55112 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Aff2O55112 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Aff2O55112 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff2O55112 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Aff2O55112 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff2O55112 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff2O55112 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Aff2O55112 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Aff2O55112 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff2O55112 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff2O55112 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff2O55112 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff2O55112 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff2O55112 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff2O55112 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff2O55112 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff2O55112 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff2O55112 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Aff2O55112 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff2O55112 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Aff2O55112 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Aff2O55112 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Aff2O55112 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aff2O55112 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Aff2O55112 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aff2O55112 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aff2O55112 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aff2O55112 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aff2O55112 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Aff2O55112 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms