Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Syngr2O55101 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms