Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copb2O55029 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copb2O55029 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copb2O55029 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copb2O55029 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Copb2O55029 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copb2O55029 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms