Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Csnk2a2O54833 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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