Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atp10aO54827 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp10aO54827 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms