Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FxnO35943 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FxnO35943 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FxnO35943 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FxnO35943 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FxnO35943 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FxnO35943 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FxnO35943 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FxnO35943 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FxnO35943 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FxnO35943 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FxnO35943 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FxnO35943 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FxnO35943 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FxnO35943 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FxnO35943 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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FxnO35943 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FxnO35943 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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FxnO35943 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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FxnO35943 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FxnO35943 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FxnO35943 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
FxnO35943 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FxnO35943 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FxnO35943 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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FxnO35943 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
FxnO35943 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
FxnO35943 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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FxnO35943 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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FxnO35943 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FxnO35943 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FxnO35943 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FxnO35943 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FxnO35943 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FxnO35943 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FxnO35943 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FxnO35943 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FxnO35943 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FxnO35943 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FxnO35943 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FxnO35943 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FxnO35943 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FxnO35943 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FxnO35943 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FxnO35943 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FxnO35943 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FxnO35943 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FxnO35943 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FxnO35943 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FxnO35943 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FxnO35943 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FxnO35943 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FxnO35943 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FxnO35943 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FxnO35943 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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