Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek2O35942 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek2O35942 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek2O35942 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nek2O35942 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek2O35942 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nek2O35942 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nek2O35942 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms