Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Sp100O35892 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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