Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops5O35864 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Cops5O35864 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Cops5O35864 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Cops5O35864 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Cops5O35864 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Cops5O35864 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Cops5O35864 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Cops5O35864 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cops5O35864 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cops5O35864 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cops5O35864 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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