Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna3O35344 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms