Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pitx3O35160 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms