Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Scarb2O35114 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Scarb2O35114 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scarb2O35114 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Scarb2O35114 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms