Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

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Length 796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif3cO35066 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif3cO35066 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms