Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Casq1O09165 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casq1O09165 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casq1O09165 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casq1O09165 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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