Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EllO08856 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EllO08856 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EllO08856 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EllO08856 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EllO08856 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EllO08856 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EllO08856 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EllO08856 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EllO08856 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EllO08856 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EllO08856 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EllO08856 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EllO08856 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EllO08856 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EllO08856 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EllO08856 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EllO08856 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EllO08856 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EllO08856 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EllO08856 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EllO08856 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EllO08856 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EllO08856 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EllO08856 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EllO08856 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EllO08856 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EllO08856 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EllO08856 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EllO08856 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EllO08856 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EllO08856 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EllO08856 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EllO08856 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EllO08856 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EllO08856 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EllO08856 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EllO08856 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EllO08856 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EllO08856 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EllO08856 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EllO08856 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EllO08856 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EllO08856 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EllO08856 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EllO08856 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EllO08856 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms