Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3542K7N6U2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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