Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm2056J3QQ02 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm2056J3QQ02 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm2056J3QQ02 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm2056J3QQ02 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm2056J3QQ02 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm2056J3QQ02 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm2056J3QQ02 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm2056J3QQ02 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm2056J3QQ02 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm2056J3QQ02 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm2056J3QQ02 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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