Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP8

Alkal1, ALK and LTK ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkal1J3QPP8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Alkal1J3QPP8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms