Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm8356J3QPD3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm8356J3QPD3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8356J3QPD3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8356J3QPD3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8356J3QPD3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8356J3QPD3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8356J3QPD3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8356J3QPD3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8356J3QPD3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8356J3QPD3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8356J3QPD3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8356J3QPD3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8356J3QPD3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8356J3QPD3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8356J3QPD3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8356J3QPD3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8356J3QPD3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8356J3QPD3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8356J3QPD3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8356J3QPD3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8356J3QPD3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8356J3QPD3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm8356J3QPD3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms