Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 91 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smim22J3QP37 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms