Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Fam240aJ3QNP9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam240aJ3QNP9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam240aJ3QNP9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam240aJ3QNP9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Fam240aJ3QNP9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Fam240aJ3QNP9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam240aJ3QNP9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam240aJ3QNP9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam240aJ3QNP9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam240aJ3QNP9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Fam240aJ3QNP9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Fam240aJ3QNP9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Fam240aJ3QNP9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam240aJ3QNP9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Fam240aJ3QNP9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Fam240aJ3QNP9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam240aJ3QNP9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam240aJ3QNP9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam240aJ3QNP9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam240aJ3QNP9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Fam240aJ3QNP9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Fam240aJ3QNP9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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