Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm17577J3QNF7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm17577J3QNF7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm17577J3QNF7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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