Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ccdc180J3QNE4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc180J3QNE4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms