Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm21818J3KMS6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
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