Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20828J3KMI7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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Gm20828J3KMI7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Gm20828J3KMI7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms