Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm29394H3BIW7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms