Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arfip1G5E8V9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfip1G5E8V9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfip1G5E8V9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfip1G5E8V9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfip1G5E8V9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfip1G5E8V9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfip1G5E8V9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfip1G5E8V9 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfip1G5E8V9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfip1G5E8V9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfip1G5E8V9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfip1G5E8V9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfip1G5E8V9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfip1G5E8V9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfip1G5E8V9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfip1G5E8V9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfip1G5E8V9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfip1G5E8V9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfip1G5E8V9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfip1G5E8V9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfip1G5E8V9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arfip1G5E8V9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms