Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Arfgef1G3X9K3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms