Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SprtnG3X912 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SprtnG3X912 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SprtnG3X912 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SprtnG3X912 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SprtnG3X912 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SprtnG3X912 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SprtnG3X912 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SprtnG3X912 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SprtnG3X912 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms