Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl26F8VQM2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl26F8VQM2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms