Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Colca2F8VPY8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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