Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3371F7CQW8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms