Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm8005F6YKY3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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