Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox13F6YCR7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox13F6YCR7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms