Protein–RNA interactions for Protein: F6XZJ7

Samd15, Sterile alpha motif domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd15F6XZJ7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Samd15F6XZJ7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Samd15F6XZJ7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms