Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SmgcF6VRN1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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